Se denomina acuaponia a la técnica de cultivo integrado entre plantas (de manera hidropónica) y la acuicultura (cultivo de peces). La practica de la acuaponia es muy valiosa ya que al incorporar ambos cultivos de manera integral se aprovechan grandemente los recursos. El desperdicio de los peces provee a las plantas alimento organico de la mejor calidad, y a su vez las plantas actúan como filtro natural del agua en que viven los peces. Existen otros participantes; los microbios (bacterias nitrificantes). Ellas realizan el trabajo de convertir la amonia resultante del desperdicio de los peces primero en nitritos y luego en nitratos, para el consumo de las plantas. Y las lombrices rojas composteras que viven en el sustrato o medio de crecimiento y transforman los desperdicios solidos en fertilizante.
En la acuaponia se utilizan los desperdicios de los peces como nutrientes para las plantas. A su vez se utilizan las plantas para filtrar y mantener la calidad optima del agua en que habitan los peces.